A fennmaradt leírások alapján a #3-as és a késõbbi típusú univerzális mikroszkópjainak rendkívüli finomsága a fluoreszcencia, a polarizáció, a sötétmezõs és interferencia elveinek egyesítésének volt köszönhetõ. Fénysugárt használt a minták elszíneztetésére, mert a kémiai reagensek vagy tönkretették a mintákat, vagy molekulárisan túl nagyok voltak.
Rife-nak 1920-tól sikerült elérnie azt, amit a mai elektron-mikroszkópokkal még ma sem lehet kimutatni: élõben, színesben és nagy felbontás mellett tudta vizsgálni a mikróbákat. Ezt rés-spektroszkópiával, precízen állítható és forgatható kvartz-prizmákkal, túlnyomórészt ibolyántúli fénysugárzások két ilyen, a minta által kiválasztott, egymástól kissé eltérõ hullámhosszával tudta elérni. Ezek a kiválasztott, többnyire a látható fény spektrumán kívül álló frekvenciák voltak azok amik rezonálva láthatóvá tették a mikróbákat. Ez a két fény-hullámhossz interferenciát okozott, ami így nagyobbá vált, és már a látható fény spektrumába esett. Ezzel Rife volt az elsõ kutató, aki élõ mikróbákat tudott vizsgálni.
   Mivel az organizmusok 75%-a a látható fény spektrumán kívül álló hullámhosszakkal volt csak gerjeszthetõ, ezért a mai kutatók jelenleg is a sötétben tapogatóznak és csak fekete-fehérben, az elpusztított minták látható tetemeit tudják vizsgálni. Rife jóval megelõzte korát!
Rife felfedezte a mikroszkópjaival, hogy rendkívül kis méretû (kb 50-120 nm) baktérium/vírus kinézetû részecskék "brown-mozgásban" vannak, amelyek messze kisebb méretûek a megszokott baktériumi méreteknél, és sokkal elevenebbek a megszokott baktériumi lomha mozgásnál.
   Hosszú, évekig tartó tanulmányai során észrevette hogy minden egyes vírusnak, vagy baktériumnak van egy saját rezonáns frekvenciája, ami sebezhetõvé is teszi azokat. Például, azt mondta, hogy a rákos daganatban levõ organizmusok arról voltak felismerhetõk, hogy egy jellegzetes lilás-vörös kisugárzást adtak. Ezeket a rendkívül kisméretû, lilás-vörösen fénylõ, élõ alakzatokat BX bacilusoknak nevezte. Errõl a speciálisan fénylõ mivoltukról voltak felismerhetõek más közegekben is. Rife precizitására utal az is, hogy több mint 400-szor megismételte kísérleteit, és minden egyes alkalommal a BX típusú bacilus mindig rákos daganatot keltett. Akárcsak ahogy azt egy francia kutató-tudós, Béchamp korábban feltételezte, azt észlelte, hogy az alaptípusú élõ mikro-alakzatok, amik anatómiailag minden organikus közegben jelen vannak, csak bizonyos betegséget kiváltó feltételek esetén alakulnak át betegséget okozó formává. A betegség nem azért lett mert valami mikro-organizmus bekerült a szervezetbe. Az mindig is ott volt, csak valami átalakította egy betegséget okozó formává. Az eredeti kiváltó ok tehát nem a vírus, hanem például egy sokk, vagy toxinok, vagy sugárzás, vagy negatív gondolkodásmód, stb. - azaz mindig a legyengült test kémiai traumája, ami oxigénhiányos szöveteket eredményez, savas kémhatással, ami a mikróbák elszaporodásának kedvez.
   Rife szerint csak kb 10 alap-mikróba létezhet. Abban a környezetben ahol ezek élnek a környezet pH változása, vagy méreganyag-tartalom változása az ami kiváltja ezen mikróbák variációit. Rife kísérletekkel is képes volt igazolni, hogy a betegséget kiváltó és az ártalmatlan típusok a környezet megváltozásával egymásba alakíthatóak, oda-vissza. Rife szerint a rákos mikroorganizmus 4 eltérõ formát vehet fel: BX (carcinoma), nagyobb méretû BY (sarcoma), monococcoid forma (a rákos betegek 90%-ánál a vérben kimutatható), a crytomyces pleomorphia fungi forma és ezek mindegyike 36 óra alatt visszaalakítható a 67 nm hosszú, 50 nm széles BX-é. Rife ezzel bizonyíthatóvá tette a mikróbák egymásba válthatóságát (pleomorphism), amit bizonyosság végett több mint 300 alkalommal megismételt, mindig azonos és pozitív eredménnyel.

 

A frekvenciák
   A szuperfinom mikroszkópjainak köszönhetõen felfedezte, hogy minden ilyen kis méretû és betegségeket keltõ organizmusok sebezhetõek egy speciális frekvencia-besugárzással, ami más élõ közegre egyáltalán nincs hatással. Évekig kísérletezgetve feltérképezte minden általa veszélyesnek tartott baktérium, vírus halálos oszcilláló frekvenciáját. Sok ilyen frekvenciát állapított meg.
Rife többféle ilyen rezonáns frekvenciákon mûködõ készüléket alkotott különféle betegségek, többek között a rák-betegség, gyógyítására.